Las hadas Rabirin, Pegitan y Nyatoran son transportadas misteriosamente a algún lugar donde se encuentran con el hada, Mirakurun, que está siendo perseguida. Mirakurun crea tres Miracle Lights para ellos y transporta al trío de regreso. Mientras tanto, Nodoka se encuentra con los equipos Huggto y Star Twinkle Precure, quienes luego se encuentran con Refrain mientras intenta capturar a Mirakurun. Refrain ha estado haciendo retroceder el reloj todos los días, pero aquellos que tienen Miracle Lights no se ven afectados por sus poderes.